MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes N53-1 complete genome

Total Repeats: 50873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020558	CAAT	2	8	321	328	50 %	25 %	0 %	25 %	470208774
2	NC_020558	A	8	8	363	370	100 %	0 %	0 %	0 %	470208774
3	NC_020558	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208774
4	NC_020558	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208774
5	NC_020558	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208774
6	NC_020558	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208774
7	NC_020558	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208774
8	NC_020558	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	470208774
9	NC_020558	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208774
10	NC_020558	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208774
11	NC_020558	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208774
12	NC_020558	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208774
13	NC_020558	CTTA	2	8	944	951	25 %	50 %	0 %	25 %	470208774
14	NC_020558	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208774
15	NC_020558	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208774
16	NC_020558	AC	3	6	1015	1020	50 %	0 %	0 %	50 %	470208774
17	NC_020558	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208774
18	NC_020558	ATT	3	9	1041	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208774
19	NC_020558	GACC	2	8	1056	1063	25 %	0 %	25 %	50 %	470208774
20	NC_020558	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208774
21	NC_020558	A	6	6	1173	1178	100 %	0 %	0 %	0 %	470208774
22	NC_020558	AGT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208774
23	NC_020558	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208774
24	NC_020558	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208774
25	NC_020558	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208774
26	NC_020558	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208774
27	NC_020558	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208774
28	NC_020558	CGTT	2	8	1418	1425	0 %	50 %	25 %	25 %	470208774
29	NC_020558	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208774
30	NC_020558	A	7	7	1442	1448	100 %	0 %	0 %	0 %	470208774
31	NC_020558	TC	3	6	1490	1495	0 %	50 %	0 %	50 %	470208774
32	NC_020558	AG	3	6	1497	1502	50 %	0 %	50 %	0 %	470208774
33	NC_020558	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208774
34	NC_020558	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208774
35	NC_020558	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208774
36	NC_020558	A	6	6	1579	1584	100 %	0 %	0 %	0 %	470208774
37	NC_020558	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208774
38	NC_020558	A	7	7	1639	1645	100 %	0 %	0 %	0 %	470208774
39	NC_020558	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208775
40	NC_020558	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208775
41	NC_020558	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208775
42	NC_020558	TGG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208775
43	NC_020558	TCG	2	6	2124	2129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208775
44	NC_020558	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208775
45	NC_020558	ACCAA	2	10	2171	2180	60 %	0 %	0 %	40 %	470208775
46	NC_020558	CCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470208775
47	NC_020558	A	6	6	2292	2297	100 %	0 %	0 %	0 %	470208775
48	NC_020558	TACT	2	8	2348	2355	25 %	50 %	0 %	25 %	470208775
49	NC_020558	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208775
50	NC_020558	ACA	2	6	2462	2467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208775
51	NC_020558	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	470208775
52	NC_020558	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208775
53	NC_020558	TTAAA	2	10	2564	2573	60 %	40 %	0 %	0 %	470208775
54	NC_020558	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208775
55	NC_020558	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208775
56	NC_020558	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208775
57	NC_020558	TCC	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470208775
58	NC_020558	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208775
59	NC_020558	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208775
60	NC_020558	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208775
61	NC_020558	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208776
62	NC_020558	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208776
63	NC_020558	T	7	7	3161	3167	0 %	100 %	0 %	0 %	470208776
64	NC_020558	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208776
65	NC_020558	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208776
66	NC_020558	GCT	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208776
67	NC_020558	T	7	7	3294	3300	0 %	100 %	0 %	0 %	470208776
68	NC_020558	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208776
69	NC_020558	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208776
70	NC_020558	T	6	6	3419	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	470208776
71	NC_020558	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208776
72	NC_020558	CTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208776
73	NC_020558	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208776
74	NC_020558	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208776
75	NC_020558	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208776
76	NC_020558	T	7	7	3617	3623	0 %	100 %	0 %	0 %	470208776
77	NC_020558	T	6	6	3657	3662	0 %	100 %	0 %	0 %	470208776
78	NC_020558	TGT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208776
79	NC_020558	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208776
80	NC_020558	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208776
81	NC_020558	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208776
82	NC_020558	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208776
83	NC_020558	TCC	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	470208776
84	NC_020558	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208776
85	NC_020558	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208776
86	NC_020558	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	470208776
87	NC_020558	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208776
88	NC_020558	TTTGT	2	10	4327	4336	0 %	80 %	20 %	0 %	470208776
89	NC_020558	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208776
90	NC_020558	A	7	7	4436	4442	100 %	0 %	0 %	0 %	470208776
91	NC_020558	CGA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208776
92	NC_020558	TAT	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208777
93	NC_020558	A	7	7	4620	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	470208777
94	NC_020558	TGAT	2	8	4702	4709	25 %	50 %	25 %	0 %	470208777
95	NC_020558	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208777
96	NC_020558	AACC	2	8	4976	4983	50 %	0 %	0 %	50 %	470208778
97	NC_020558	TGCT	2	8	5002	5009	0 %	50 %	25 %	25 %	470208778
98	NC_020558	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	470208778
99	NC_020558	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208778
100	NC_020558	ATTT	2	8	5301	5308	25 %	75 %	0 %	0 %	470208778
101	NC_020558	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208778
102	NC_020558	TTCA	2	8	5463	5470	25 %	50 %	0 %	25 %	470208778
103	NC_020558	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208778
104	NC_020558	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208778
105	NC_020558	A	6	6	5602	5607	100 %	0 %	0 %	0 %	470208778
106	NC_020558	AATC	2	8	5611	5618	50 %	25 %	0 %	25 %	470208778
107	NC_020558	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208778
108	NC_020558	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208778
109	NC_020558	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208778
110	NC_020558	CTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	470208778
111	NC_020558	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208778
112	NC_020558	CGA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	470208778
113	NC_020558	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208778
114	NC_020558	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208778
115	NC_020558	A	7	7	5969	5975	100 %	0 %	0 %	0 %	470208778
116	NC_020558	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208779
117	NC_020558	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	470208779
118	NC_020558	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208779
119	NC_020558	GAAATT	2	12	6231	6242	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	470208779
120	NC_020558	A	6	6	6310	6315	100 %	0 %	0 %	0 %	470208779
121	NC_020558	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	470208779
122	NC_020558	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208779
123	NC_020558	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	470208779
124	NC_020558	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	470208779
125	NC_020558	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208779
126	NC_020558	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208779
127	NC_020558	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208779
128	NC_020558	TCGTAC	2	12	6620	6631	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	470208779
129	NC_020558	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	470208779
130	NC_020558	TAAA	2	8	6751	6758	75 %	25 %	0 %	0 %	470208779
131	NC_020558	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	470208779
132	NC_020558	ATTT	2	8	6786	6793	25 %	75 %	0 %	0 %	470208779
133	NC_020558	GAT	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	470208779
134	NC_020558	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	470208779
135	NC_020558	CAT	2	6	6860	6865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	470208779
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260	NC_020558	CAA	2	6	13085	13090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	470208784
261	NC_020558	TA	3	6	13106	13111	50 %	50 %	0 %	0 %	470208784
262	NC_020558	A	6	6	13138	13143	100 %	0 %	0 %	0 %	470208784
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